UN ARTICLE DE FUTURA SCIENCES
Vous pouvez lire sur Futura Sciences un article signé Corine Deluzarche. Son titre : « Pourquoi un taux de vaccination élevé peut paradoxalement favoriser l’émergence de variants résistants ? » La question est d’importance. Reste à voir les réponses analysées ci-dessous.
L’auteur s’appuie sur une étude de simulation sur « la probabilité qu’une souche résistante émerge au sein d’une population de 10 millions d’habitants d’ici trois ans… » Différents paramètres sont pris en compte, à savoir les alternances de vaccination, mutations, vagues successives, etc.[1]
L’étude apporte des conclusions de deux ordres :
1/ « Une vaccination rapide et un faible niveau de circulation réduisent le risque d’émergence d’un variant résistant.
2/ Le risque [d’émergence d’un variant résistant] est maximal lorsqu’une grande partie de la population est vaccinée, mais pas suffisamment pour assurer une immunité de groupe.
Résumons : Il existe un phénomène de « pression de sélection : « plus le nombre de personnes vaccinées augmente, plus l’avantage compétitif des souches résistantes au vaccin s’accroît. »
Il s’en déduit aussi que « le pic de probabilité est ainsi situé autour de 60 % [de personnes vaccinées] alors que le « seuil d’immunité collective se situe plutôt autour de 90% selon la Haute Autorité de Santé. »
Suivent d’autres conclusions sur la très difficile, pour ne pas dire quasi impossible atteinte de ces taux extraordinaires de vaccinations (surtout en considérant les disparités selon les pays) et le conseil de maintenir de méthodes restrictives (masques, etc.).
L’ARTICLE PRINCEPS
Il est publié le 30 juillet dernier dans Nature sous l’égide de Simon A. Rella, de l’Institut autrichien de science et technologie. Si vous n’aimez pas les statistiques et êtes réticents à l’anglais, n’y allez pas, d’autant qu’ils ont utilisé une mise à jour personnelle du modèle SIR qui considère la suite espérée d’un individu qui passe de l’état S (sain) à I (infecté) puis R (guéri). Des compartiments ont été ajoutés : V (vacciné), Ir (infecté par une souche résistante) et Irv (vacciné et infecté par la souche résistante), et bien d’autres paramètres et fonctions (voir illustration).
Faisons confiance à leurs chiffres, et tirons-en la quintessence.
La traduction de Futura est bonne, à quelques réserves.
Dans l’article de Nature, on recommande non seulement les gestes classiques mais aussi l’augmentation en nombre et en secteurs des tests diagnostiques, le traçage rigoureux des contacts, l’augmentation du séquençage génétique des virus des cas positifs.
Dans l’article de Futura il manque aussi une phrase, sur laquelle je reviendrai. Mais il marque un bon point en terminant ainsi :
« Ce serait une utopie de croire que seule la vaccination nous tirerait de cette pandémie confirme Antoine Flahault, épidémiologiste et directeur de l’Institut de santé globale à l’université de Genève. Une pilule difficile à avaler pour tous ceux qui avaient cru que la vaccination leur permettrait de revenir à une vie normale. »
LA PHRASE CLEF DE NATURE ET SON SENS PROFOND
La voici : toutes ces mesures citées plus haut « pendant une période de temps raisonnable, [doivent] permettre aux lignées émergentes de souches résistantes de disparaître par une dérive [variation] génétique stochastique [dépendant du hasard]. »[2]
Cette phrase pose deux éléments fondamentaux :
- La période de temps raisonnable
- Le rôle final de l’extinction des souches résistantes.
LA PÉRIODE DE TEMPS RAISONNABLE
Après tous les atermoiements, prédictions catastrophiques, mensonges, décrets à répétition, et autres coups de menton, état d’urgence sanitaire et confinements, passe et tours de passe-passe, est-il raisonnable de parler de « période de temps raisonnable » en macronie ? Tout cela « en même temps » et « quoi qu’il en coûte ? »
Est-il possible de rendre « raisonnable » le vacancier en polo qui se prend pour un général d’armée mexicaine ? Jusqu’à présent, la faculté doit avouer son échec.
LE RÔLE FINAL DE L’EXTINCTION DES SOUCHES RÉSISTANTES
Ce sera la base de l’article prochain.
[1] https://www.nature.com/articles/s41598-021-95025-3
[2] for a reasonable period of time, to allow emergent lineages of resistant strains to go extinct through stochastic genetic drift.